Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF1Q15637 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF1Q15637 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF1Q15637 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF1Q15637 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF1Q15637 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF1Q15637 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SF1Q15637 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SF1Q15637 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SF1Q15637 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF1Q15637 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF1Q15637 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SF1Q15637 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF1Q15637 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF1Q15637 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF1Q15637 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF1Q15637 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF1Q15637 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF1Q15637 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF1Q15637 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF1Q15637 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF1Q15637 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF1Q15637 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF1Q15637 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF1Q15637 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF1Q15637 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF1Q15637 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF1Q15637 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF1Q15637 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF1Q15637 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF1Q15637 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF1Q15637 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SF1Q15637 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF1Q15637 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF1Q15637 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF1Q15637 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF1Q15637 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF1Q15637 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF1Q15637 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF1Q15637 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF1Q15637 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF1Q15637 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF1Q15637 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF1Q15637 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF1Q15637 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF1Q15637 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SF1Q15637 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SF1Q15637 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF1Q15637 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF1Q15637 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF1Q15637 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SF1Q15637 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SF1Q15637 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SF1Q15637 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF1Q15637 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SF1Q15637 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF1Q15637 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF1Q15637 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF1Q15637 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF1Q15637 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF1Q15637 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF1Q15637 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF1Q15637 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF1Q15637 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF1Q15637 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF1Q15637 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF1Q15637 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF1Q15637 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF1Q15637 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF1Q15637 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF1Q15637 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF1Q15637 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF1Q15637 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF1Q15637 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF1Q15637 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF1Q15637 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF1Q15637 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF1Q15637 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF1Q15637 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF1Q15637 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF1Q15637 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF1Q15637 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF1Q15637 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SF1Q15637 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF1Q15637 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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