Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFRLQ15198 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRLQ15198 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFRLQ15198 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFRLQ15198 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDGFRLQ15198 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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