Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KARSQ15046 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KARSQ15046 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KARSQ15046 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KARSQ15046 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KARSQ15046 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KARSQ15046 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KARSQ15046 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KARSQ15046 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KARSQ15046 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KARSQ15046 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KARSQ15046 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KARSQ15046 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KARSQ15046 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KARSQ15046 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KARSQ15046 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KARSQ15046 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KARSQ15046 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KARSQ15046 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KARSQ15046 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KARSQ15046 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KARSQ15046 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KARSQ15046 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KARSQ15046 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KARSQ15046 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KARSQ15046 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KARSQ15046 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KARSQ15046 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KARSQ15046 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KARSQ15046 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KARSQ15046 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KARSQ15046 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KARSQ15046 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KARSQ15046 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KARSQ15046 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KARSQ15046 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KARSQ15046 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KARSQ15046 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KARSQ15046 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KARSQ15046 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KARSQ15046 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KARSQ15046 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KARSQ15046 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KARSQ15046 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KARSQ15046 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KARSQ15046 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KARSQ15046 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KARSQ15046 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KARSQ15046 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KARSQ15046 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KARSQ15046 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KARSQ15046 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KARSQ15046 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KARSQ15046 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KARSQ15046 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KARSQ15046 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KARSQ15046 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KARSQ15046 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KARSQ15046 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KARSQ15046 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KARSQ15046 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KARSQ15046 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KARSQ15046 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KARSQ15046 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KARSQ15046 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KARSQ15046 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KARSQ15046 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KARSQ15046 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KARSQ15046 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KARSQ15046 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KARSQ15046 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KARSQ15046 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KARSQ15046 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KARSQ15046 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KARSQ15046 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KARSQ15046 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KARSQ15046 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KARSQ15046 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KARSQ15046 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KARSQ15046 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KARSQ15046 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KARSQ15046 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KARSQ15046 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KARSQ15046 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KARSQ15046 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KARSQ15046 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KARSQ15046 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KARSQ15046 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KARSQ15046 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KARSQ15046 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KARSQ15046 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KARSQ15046 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KARSQ15046 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KARSQ15046 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KARSQ15046 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KARSQ15046 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KARSQ15046 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KARSQ15046 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KARSQ15046 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KARSQ15046 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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