Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 27.48□□□□□ -1.217e-10■■■■■ 35.4
NOLC1Q14978 RPL13A-205ENST00000474171 521 ntTSL 212.27□□□□□ -0.451e-323■■■■■ 35.3
NOLC1Q14978 SNHG1-214ENST00000540865 784 ntTSL 54.94□□□□□ -1.621e-323■■■■■ 35.2
NOLC1Q14978 SNHG1-202ENST00000535689 550 ntTSL 24.21□□□□□ -1.741e-323■■■■■ 35.2
NOLC1Q14978 COX6C-211ENST00000606245 646 nt12.8□□□□□ -0.364e-20■■■■■ 35
NOLC1Q14978 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.134e-9■■■■■ 35
NOLC1Q14978 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 35
NOLC1Q14978 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 35
NOLC1Q14978 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 35
NOLC1Q14978 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.524e-9■■■■■ 35
NOLC1Q14978 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.914e-9■■■■■ 35
NOLC1Q14978 IMMT-205ENST00000419070 2172 ntTSL 58.99□□□□□ -0.974e-9■■■■■ 35
NOLC1Q14978 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.225e-16■■■■■ 34.9
NOLC1Q14978 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.065e-16■■■■■ 34.9
NOLC1Q14978 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.922e-20■■■■■ 34.8
NOLC1Q14978 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.512e-20■■■■■ 34.8
NOLC1Q14978 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.992e-20■■■■■ 34.8
NOLC1Q14978 PPAN-205ENST00000446223 844 ntTSL 320.05■□□□□ 0.82e-20■■■■■ 34.8
NOLC1Q14978 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-20■■■■■ 34.8
NOLC1Q14978 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.064e-43■■■■■ 34.8
NOLC1Q14978 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 34.8
NOLC1Q14978 UQCRC1-203ENST00000415995 1387 ntTSL 517.57■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 34.8
NOLC1Q14978 SNHG1-215ENST00000540904 594 ntTSL 510.11□□□□□ -0.791e-323■■■■■ 34.6
NOLC1Q14978 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 410.42□□□□□ -0.741e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 29.25□□□□□ -0.931e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 38.33□□□□□ -1.081e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.221e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.44□□□□□ -1.71e-323■■■■■ 34.5
NOLC1Q14978 DHX9-202ENST00000473076 1378 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.063e-11■■■■■ 34.3
NOLC1Q14978 DHX9-207ENST00000485081 2531 ntTSL 213.51□□□□□ -0.253e-11■■■■■ 34.3
NOLC1Q14978 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-11■■■■■ 34.3
NOLC1Q14978 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-12■■■■■ 34.3
NOLC1Q14978 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-12■■■■■ 34.3
NOLC1Q14978 RPS27A-208ENST00000478196 580 ntTSL 25.3□□□□□ -1.568e-18■■■■■ 34.3
NOLC1Q14978 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.543e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-226ENST00000486210 548 ntTSL 318.99■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-215ENST00000433807 557 ntTSL 414.32□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 SLC1A4-203ENST00000480594 5789 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.52□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 34
NOLC1Q14978 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.31□□□□□ -1.723e-8■■■■■ 33.9
NOLC1Q14978 CCT6A-208ENST00000493855 261 ntTSL 23.85□□□□□ -1.793e-8■■■■■ 33.9
NOLC1Q14978 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.299e-8■■■■■ 33.9
NOLC1Q14978 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 33.9
NOLC1Q14978 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 59.8□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 33.9
NOLC1Q14978 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.221e-323■■■■■ 33.9
NOLC1Q14978 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.53e-25■■■■■ 33.7
NOLC1Q14978 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-25■■■■■ 33.7
NOLC1Q14978 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 33.6
NOLC1Q14978 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 33.6
NOLC1Q14978 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 33.6
NOLC1Q14978 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 318.8■□□□□ 0.61e-323■■■■■ 33.6
NOLC1Q14978 AC109830.1-201ENST00000504728 744 ntTSL 38.59□□□□□ -1.032e-9■■■■■ 33.5
NOLC1Q14978 WDR74-208ENST00000538098 548 ntTSL 419.27■□□□□ 0.681e-323■■■■■ 33.3
NOLC1Q14978 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.581e-323■■■■■ 33.3
NOLC1Q14978 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.941e-323■■■■■ 33.3
NOLC1Q14978 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 33.2
NOLC1Q14978 RGS10-203ENST00000392865 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.754e-9■■■■■ 33.2
NOLC1Q14978 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 33.2
NOLC1Q14978 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.792e-15■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-15■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-15■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PARK7-202ENST00000377488 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.372e-15■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-15■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PARK7-207ENST00000469225 711 ntTSL 310.22□□□□□ -0.772e-15■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 UQCRC1-208ENST00000472438 477 ntTSL 215.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-207ENST00000484562 5448 ntTSL 1 (best)12.42□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-201ENST00000307297 1585 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-214ENST00000635023 5242 ntTSL 510.64□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-208ENST00000484937 4990 ntTSL 510.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-216ENST00000635214 4863 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-204ENST00000459752 5349 ntTSL 1 (best)9.93□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-207ENST00000547869 1018 ntTSL 28.6□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 23.9□□□□□ -1.794e-8■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC6.5□□□□□ -1.371e-26■■■■■ 32.9
NOLC1Q14978 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 32.7
NOLC1Q14978 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 32.7
NOLC1Q14978 RPL13A-204ENST00000472481 728 ntTSL 216.71■□□□□ 0.271e-323■■■■■ 32.7
NOLC1Q14978 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.664e-9■■■■■ 32.5
NOLC1Q14978 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.944e-9■■■■■ 32.5
NOLC1Q14978 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.44e-9■■■■■ 32.5
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 171.6 ms