Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN5AQ14524 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN5AQ14524 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN5AQ14524 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN5AQ14524 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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