Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms