Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC2Q13868 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC2Q13868 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC2Q13868 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC2Q13868 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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