Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF4BQ13523 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF4BQ13523 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF4BQ13523 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF4BQ13523 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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