Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIGQ13278 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIGQ13278 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIGQ13278 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIGQ13278 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIGQ13278 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RIGQ13278 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIGQ13278 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIGQ13278 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIGQ13278 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIGQ13278 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIGQ13278 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIGQ13278 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIGQ13278 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIGQ13278 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIGQ13278 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIGQ13278 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIGQ13278 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIGQ13278 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIGQ13278 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIGQ13278 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIGQ13278 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIGQ13278 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIGQ13278 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIGQ13278 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIGQ13278 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIGQ13278 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIGQ13278 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIGQ13278 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIGQ13278 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIGQ13278 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIGQ13278 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIGQ13278 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIGQ13278 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIGQ13278 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RIGQ13278 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIGQ13278 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIGQ13278 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIGQ13278 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIGQ13278 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIGQ13278 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIGQ13278 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIGQ13278 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIGQ13278 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIGQ13278 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIGQ13278 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIGQ13278 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIGQ13278 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIGQ13278 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIGQ13278 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIGQ13278 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIGQ13278 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIGQ13278 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIGQ13278 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIGQ13278 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIGQ13278 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIGQ13278 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIGQ13278 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIGQ13278 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIGQ13278 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RIGQ13278 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RIGQ13278 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RIGQ13278 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIGQ13278 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIGQ13278 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIGQ13278 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIGQ13278 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIGQ13278 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIGQ13278 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIGQ13278 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIGQ13278 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIGQ13278 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIGQ13278 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIGQ13278 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIGQ13278 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIGQ13278 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIGQ13278 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIGQ13278 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIGQ13278 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIGQ13278 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIGQ13278 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIGQ13278 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIGQ13278 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIGQ13278 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIGQ13278 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIGQ13278 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIGQ13278 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIGQ13278 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIGQ13278 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIGQ13278 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIGQ13278 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIGQ13278 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIGQ13278 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIGQ13278 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIGQ13278 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIGQ13278 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIGQ13278 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIGQ13278 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIGQ13278 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RIGQ13278 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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