Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 KPNA1-203ENST00000465882 1062 ntTSL 311.47□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 33.5
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ILF3Q12906 KPNA1-206ENST00000476916 575 ntTSL 46.59□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 33.5
ILF3Q12906 KPNA1-207ENST00000482287 727 ntTSL 35.81□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 33.5
ILF3Q12906 KPNA1-205ENST00000470904 3060 ntTSL 25.66□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 33.5
ILF3Q12906 KPNA1-202ENST00000464940 582 ntTSL 45.2□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 33.5
ILF3Q12906 KPNA1-208ENST00000485027 1843 ntTSL 25.15□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 33.5
ILF3Q12906 KPNA1-204ENST00000466923 3316 ntTSL 24.85□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 33.5
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ILF3Q12906 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 55.59□□□□□ -1.511e-9■■■■■ 33.4
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ILF3Q12906 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 33.4
ILF3Q12906 TIA1-218ENST00000496096 511 ntTSL 36.95□□□□□ -1.34e-8■■■■■ 33.3
ILF3Q12906 TIA1-207ENST00000454815 911 ntTSL 54.53□□□□□ -1.684e-8■■■■■ 33.3
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ILF3Q12906 TIA1-214ENST00000482876 562 ntTSL 53.63□□□□□ -1.834e-8■■■■■ 33.3
ILF3Q12906 TIA1-212ENST00000477415 510 ntTSL 23.56□□□□□ -1.844e-8■■■■■ 33.3
ILF3Q12906 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 33.2
ILF3Q12906 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 33.2
ILF3Q12906 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.037e-11■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 MCM9-203ENST00000368478 469 ntTSL 28.6□□□□□ -1.033e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.553e-10■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.745e-9■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 USP39-218ENST00000493829 1660 ntTSL 218.98■□□□□ 0.635e-9■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.495e-9■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.199e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.25e-9■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.248e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.588e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.68e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC10.58□□□□□ -0.728e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 USP13-205ENST00000497380 509 ntTSL 310.3□□□□□ -0.768e-10■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 49.77□□□□□ -0.858e-10■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.18e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.138e-10■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 46.92□□□□□ -1.38e-10■■■■■ 33.1
ILF3Q12906 USP39-213ENST00000467885 338 ntTSL 55.79□□□□□ -1.485e-9■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 CHD1-209ENST00000512844 848 ntTSL 55.15□□□□□ -1.598e-10■■■■■ 33.1
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ILF3Q12906 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 412.73□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 33
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ILF3Q12906 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 33
ILF3Q12906 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 33
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ILF3Q12906 HNMT-207ENST00000480534 339 ntTSL 36.28□□□□□ -1.46e-9■■■■■ 33
ILF3Q12906 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.526e-9■■■■■ 33
ILF3Q12906 HNMT-205ENST00000467390 532 ntTSL 24.57□□□□□ -1.686e-9■■■■■ 33
ILF3Q12906 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.696e-9■■■■■ 33
ILF3Q12906 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.726e-9■■■■■ 33
ILF3Q12906 HNMT-208ENST00000485653 675 ntTSL 53.09□□□□□ -1.916e-9■■■■■ 33
ILF3Q12906 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 33
ILF3Q12906 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 33
ILF3Q12906 AL391244.3-201ENST00000607307 1523 ntBASIC10.17□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 32.8
ILF3Q12906 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)20.96■□□□□ 0.958e-9■■■■■ 32.7
ILF3Q12906 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 214.73□□□□□ -0.058e-9■■■■■ 32.7
ILF3Q12906 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 314.52□□□□□ -0.098e-9■■■■■ 32.7
ILF3Q12906 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.578e-9■■■■■ 32.7
ILF3Q12906 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.728e-9■■■■■ 32.7
ILF3Q12906 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 32.7
ILF3Q12906 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 32.7
ILF3Q12906 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 32.7
ILF3Q12906 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 32.6
ILF3Q12906 MKLN1-209ENST00000494785 2386 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 32.6
ILF3Q12906 MKLN1-206ENST00000458153 2448 ntTSL 29.1□□□□□ -0.953e-8■■■■■ 32.6
ILF3Q12906 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.913e-8■■■■■ 32.6
ILF3Q12906 NUP214-226ENST00000531600 1775 ntTSL 211□□□□□ -0.658e-13■■■■■ 32.6
ILF3Q12906 NUP214-206ENST00000470765 620 ntTSL 58.68□□□□□ -1.028e-13■■■■■ 32.6
ILF3Q12906 NUP214-205ENST00000465486 1068 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.028e-13■■■■■ 32.6
ILF3Q12906 NUP214-218ENST00000528114 575 ntTSL 47.75□□□□□ -1.178e-13■■■■■ 32.6
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