RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.56■■■■■ 5.36
USP13-202ENST00000482333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.1■■■■■ 4.33
USP13-202ENST00000482333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
USP13-202ENST00000482333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.09■■■■■ 4.01
USP13-202ENST00000482333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.07■■■■■ 4.01
USP13-202ENST00000482333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.01■■■■■ 4
USP13-202ENST00000482333 ABCC9O60706 1549 aa39.64■■■■□ 3.94
USP13-202ENST00000482333 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.44■■■■□ 3.9
USP13-202ENST00000482333 NACADO15069 1562 aa39.14■■■■□ 3.86
USP13-202ENST00000482333 SCRIBQ14160 1630 aa38.91■■■■□ 3.82
USP13-202ENST00000482333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.73■■■■□ 3.79
USP13-202ENST00000482333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
USP13-202ENST00000482333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.08■■■■□ 3.69
USP13-202ENST00000482333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
USP13-202ENST00000482333 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.8■■■■□ 3.64
USP13-202ENST00000482333 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.65■■■■□ 3.62
USP13-202ENST00000482333 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.59■■■■□ 3.61
USP13-202ENST00000482333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.51■■■■□ 3.59
USP13-202ENST00000482333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
USP13-202ENST00000482333 WIZO95785 1651 aa37.32■■■■□ 3.56
USP13-202ENST00000482333 SMARCA4P51532 1647 aa37.27■■■■□ 3.56
USP13-202ENST00000482333 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.15■■■■□ 3.54
USP13-202ENST00000482333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
USP13-202ENST00000482333 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.75■■■■□ 3.47
USP13-202ENST00000482333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.57■■■■□ 3.44
USP13-202ENST00000482333 SMARCA2P51531 1590 aa36.57■■■■□ 3.44
USP13-202ENST00000482333 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.55■■■■□ 3.44
USP13-202ENST00000482333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
USP13-202ENST00000482333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
USP13-202ENST00000482333 TRIM41Q8WV44 630 aa36.24■■■■□ 3.39
USP13-202ENST00000482333 NCAPD3P42695 1498 aa36.16■■■■□ 3.38
USP13-202ENST00000482333 HMGXB3Q12766 1538 aa36.11■■■■□ 3.37
USP13-202ENST00000482333 ABCC8Q09428 1581 aa35.94■■■■□ 3.34
USP13-202ENST00000482333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.85■■■■□ 3.33
USP13-202ENST00000482333 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.82■■■■□ 3.32
USP13-202ENST00000482333 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
USP13-202ENST00000482333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.29
USP13-202ENST00000482333 SYNJ1O43426 1573 aa35.48■■■■□ 3.27
USP13-202ENST00000482333 CFTRP13569 1480 aa35.47■■■■□ 3.27
USP13-202ENST00000482333 SOGA1O94964 1423 aa35.33■■■■□ 3.25
USP13-202ENST00000482333 PRDM2Q13029 1718 aa35.28■■■■□ 3.24
USP13-202ENST00000482333 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.27■■■■□ 3.24
USP13-202ENST00000482333 TOP2BQ02880 1626 aa35.25■■■■□ 3.23
USP13-202ENST00000482333 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.24■■■■□ 3.23
USP13-202ENST00000482333 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.21■■■■□ 3.23
USP13-202ENST00000482333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.19■■■■□ 3.22
USP13-202ENST00000482333 EEA1Q15075 1411 aa35.18■■■■□ 3.22
USP13-202ENST00000482333 CUX1P39880 1505 aa35.12■■■■□ 3.21
USP13-202ENST00000482333 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.04■■■■□ 3.2
USP13-202ENST00000482333 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35■■■■□ 3.19
USP13-202ENST00000482333 NESP48681 1621 aa34.95■■■■□ 3.19
USP13-202ENST00000482333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.91■■■■□ 3.18
USP13-202ENST00000482333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.84■■■■□ 3.17
USP13-202ENST00000482333 GOLGA3Q08378 1498 aa34.77■■■■□ 3.16
USP13-202ENST00000482333 KIF21BO75037 1637 aa34.76■■■■□ 3.16
USP13-202ENST00000482333 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.74■■■■□ 3.15
USP13-202ENST00000482333 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.73■■■■□ 3.15
USP13-202ENST00000482333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.66■■■■□ 3.14
USP13-202ENST00000482333 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
USP13-202ENST00000482333 KIF27Q86VH2 1401 aa34.63■■■■□ 3.13
USP13-202ENST00000482333 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.63■■■■□ 3.13
USP13-202ENST00000482333 CEP162Q5TB80 1403 aa34.62■■■■□ 3.13
USP13-202ENST00000482333 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.58■■■■□ 3.13
USP13-202ENST00000482333 TOPBP1Q92547 1522 aa34.57■■■■□ 3.12
USP13-202ENST00000482333 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.56■■■■□ 3.12
USP13-202ENST00000482333 PRXQ9BXM0 1461 aa34.51■■■■□ 3.12
USP13-202ENST00000482333 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.51■■■■□ 3.12
USP13-202ENST00000482333 CUX2O14529 1486 aa34.5■■■■□ 3.11
USP13-202ENST00000482333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.49■■■■□ 3.11
USP13-202ENST00000482333 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
USP13-202ENST00000482333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.45■■■■□ 3.1
USP13-202ENST00000482333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
USP13-202ENST00000482333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.38■■■■□ 3.09
USP13-202ENST00000482333 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
USP13-202ENST00000482333 IGF1RP08069 1367 aa34.34■■■■□ 3.09
USP13-202ENST00000482333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.33■■■■□ 3.09
USP13-202ENST00000482333 CLIP1P30622 1438 aa34.26■■■■□ 3.08
USP13-202ENST00000482333 WDR97A6NE52 1622 aa34.2■■■■□ 3.06
USP13-202ENST00000482333 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
USP13-202ENST00000482333 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.15■■■■□ 3.06
USP13-202ENST00000482333 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.13■■■■□ 3.05
USP13-202ENST00000482333 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
USP13-202ENST00000482333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
USP13-202ENST00000482333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.03■■■■□ 3.04
USP13-202ENST00000482333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
USP13-202ENST00000482333 VPS8Q8N3P4 1428 aa34■■■■□ 3.03
USP13-202ENST00000482333 CUL7Q14999 1698 aa33.97■■■■□ 3.03
USP13-202ENST00000482333 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.94■■■■□ 3.02
USP13-202ENST00000482333 WDR62O43379 1518 aa33.94■■■■□ 3.02
USP13-202ENST00000482333 ARAP1Q96P48 1450 aa33.92■■■■□ 3.02
USP13-202ENST00000482333 ERCC6Q03468 1493 aa33.89■■■■□ 3.02
USP13-202ENST00000482333 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.83■■■■□ 3.01
USP13-202ENST00000482333 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
USP13-202ENST00000482333 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
USP13-202ENST00000482333 HRCP23327 699 aa33.77■■■■□ 3
USP13-202ENST00000482333 IFT140Q96RY7 1462 aa33.75■■■□□ 2.99
USP13-202ENST00000482333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.73■■■□□ 2.993e-8■■■□□ 18
USP13-202ENST00000482333 PBRM1Q86U86 1689 aa33.73■■■□□ 2.99
USP13-202ENST00000482333 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.68■■■□□ 2.98
USP13-202ENST00000482333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms