Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C1Q12789 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C1Q12789 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C1Q12789 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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