Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC46.69■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
HMGXB3Q12766 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
HMGXB3Q12766 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
HMGXB3Q12766 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
HMGXB3Q12766 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
HMGXB3Q12766 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
HMGXB3Q12766 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
HMGXB3Q12766 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
HMGXB3Q12766 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC46.63■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC46.63■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC46.59■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC46.59■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
HMGXB3Q12766 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
HMGXB3Q12766 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
HMGXB3Q12766 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
HMGXB3Q12766 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC46.53■■■■■ 5.04
HMGXB3Q12766 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
HMGXB3Q12766 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
HMGXB3Q12766 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
HMGXB3Q12766 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC46.42■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC46.4■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
HMGXB3Q12766 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
HMGXB3Q12766 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
HMGXB3Q12766 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
HMGXB3Q12766 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
HMGXB3Q12766 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
HMGXB3Q12766 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
HMGXB3Q12766 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
HMGXB3Q12766 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC46.31■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC46.3■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC46.26■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC46.26■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC46.26■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
HMGXB3Q12766 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC46.25■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.99
HMGXB3Q12766 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC46.19■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC46.19■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms