Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CPSF1Q10570 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CPSF1Q10570 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CPSF1Q10570 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CPSF1Q10570 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPSF1Q10570 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
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