Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGM3Q08188 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM3Q08188 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM3Q08188 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms