Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXM1Q08050 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXM1Q08050 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXM1Q08050 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXM1Q08050 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXM1Q08050 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXM1Q08050 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms