Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN3Q08043 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN3Q08043 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN3Q08043 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms