Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP4Q07065 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP4Q07065 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP4Q07065 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP4Q07065 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms