Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCQQ04759 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCQQ04759 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCQQ04759 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCQQ04759 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms