Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POU5F1Q01860 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POU5F1Q01860 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POU5F1Q01860 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms