Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL23P62829 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL23P62829 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL23P62829 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL23P62829 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL23P62829 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL23P62829 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL23P62829 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL23P62829 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL23P62829 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL23P62829 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL23P62829 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL23P62829 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL23P62829 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL23P62829 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL23P62829 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL23P62829 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL23P62829 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL23P62829 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL23P62829 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL23P62829 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL23P62829 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL23P62829 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL23P62829 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL23P62829 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL23P62829 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL23P62829 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL23P62829 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL23P62829 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL23P62829 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL23P62829 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL23P62829 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL23P62829 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL23P62829 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL23P62829 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL23P62829 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL23P62829 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL23P62829 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL23P62829 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL23P62829 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL23P62829 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL23P62829 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL23P62829 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL23P62829 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL23P62829 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL23P62829 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL23P62829 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL23P62829 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL23P62829 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL23P62829 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL23P62829 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL23P62829 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL23P62829 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL23P62829 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL23P62829 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL23P62829 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL23P62829 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL23P62829 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL23P62829 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL23P62829 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL23P62829 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL23P62829 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL23P62829 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL23P62829 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL23P62829 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL23P62829 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL23P62829 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL23P62829 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL23P62829 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL23P62829 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL23P62829 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL23P62829 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL23P62829 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL23P62829 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms