Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP6V0D1P61421 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V0D1P61421 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V0D1P61421 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V0D1P61421 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms