Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCE1P61221 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCE1P61221 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCE1P61221 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCE1P61221 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCE1P61221 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms