Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2NP61088 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2NP61088 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms