Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRTAP10-9P60411 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRTAP10-9P60411 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP10-9P60411 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms