Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP11P59045 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP11P59045 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP11P59045 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms