Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOX10P56693 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOX10P56693 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOX10P56693 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOX10P56693 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOX10P56693 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOX10P56693 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOX10P56693 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SOX10P56693 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOX10P56693 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOX10P56693 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOX10P56693 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOX10P56693 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOX10P56693 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOX10P56693 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOX10P56693 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOX10P56693 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOX10P56693 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOX10P56693 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOX10P56693 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOX10P56693 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOX10P56693 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOX10P56693 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOX10P56693 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOX10P56693 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOX10P56693 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOX10P56693 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOX10P56693 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOX10P56693 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOX10P56693 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOX10P56693 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOX10P56693 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOX10P56693 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SOX10P56693 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOX10P56693 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOX10P56693 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOX10P56693 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOX10P56693 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOX10P56693 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOX10P56693 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOX10P56693 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOX10P56693 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX10P56693 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX10P56693 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX10P56693 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX10P56693 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX10P56693 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX10P56693 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX10P56693 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX10P56693 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX10P56693 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX10P56693 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX10P56693 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX10P56693 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX10P56693 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX10P56693 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOX10P56693 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOX10P56693 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOX10P56693 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SOX10P56693 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SOX10P56693 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SOX10P56693 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SOX10P56693 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SOX10P56693 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SOX10P56693 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX10P56693 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX10P56693 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX10P56693 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX10P56693 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX10P56693 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX10P56693 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX10P56693 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX10P56693 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX10P56693 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX10P56693 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX10P56693 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOX10P56693 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SOX10P56693 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOX10P56693 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOX10P56693 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOX10P56693 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SOX10P56693 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SOX10P56693 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOX10P56693 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOX10P56693 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOX10P56693 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOX10P56693 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOX10P56693 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOX10P56693 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOX10P56693 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOX10P56693 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOX10P56693 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SOX10P56693 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SOX10P56693 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOX10P56693 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOX10P56693 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX10P56693 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX10P56693 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX10P56693 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX10P56693 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms