Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN5P54829 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN5P54829 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN5P54829 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN5P54829 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN5P54829 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms