Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB3P54753 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB3P54753 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB3P54753 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB3P54753 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB3P54753 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms