Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC3P53804 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC3P53804 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC3P53804 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC3P53804 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC3P53804 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC3P53804 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC3P53804 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC3P53804 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC3P53804 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC3P53804 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC3P53804 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC3P53804 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC3P53804 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC3P53804 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC3P53804 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC3P53804 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC3P53804 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC3P53804 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC3P53804 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC3P53804 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC3P53804 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC3P53804 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC3P53804 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC3P53804 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC3P53804 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC3P53804 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC3P53804 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC3P53804 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC3P53804 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC3P53804 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC3P53804 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC3P53804 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC3P53804 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC3P53804 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC3P53804 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC3P53804 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC3P53804 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC3P53804 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC3P53804 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC3P53804 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC3P53804 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC3P53804 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC3P53804 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC3P53804 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC3P53804 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC3P53804 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC3P53804 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC3P53804 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC3P53804 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC3P53804 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC3P53804 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC3P53804 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC3P53804 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC3P53804 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC3P53804 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC3P53804 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC3P53804 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC3P53804 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC3P53804 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC3P53804 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC3P53804 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC3P53804 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC3P53804 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC3P53804 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC3P53804 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC3P53804 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC3P53804 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC3P53804 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC3P53804 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC3P53804 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC3P53804 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC3P53804 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC3P53804 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC3P53804 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC3P53804 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC3P53804 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC3P53804 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC3P53804 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC3P53804 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC3P53804 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC3P53804 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC3P53804 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC3P53804 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC3P53804 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC3P53804 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC3P53804 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC3P53804 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC3P53804 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC3P53804 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC3P53804 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC3P53804 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC3P53804 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC3P53804 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC3P53804 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC3P53804 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC3P53804 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC3P53804 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC3P53804 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC3P53804 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms