Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP2S1P53680 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AP2S1P53680 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP2S1P53680 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms