Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM4P49221 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM4P49221 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM4P49221 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM4P49221 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM4P49221 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM4P49221 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM4P49221 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM4P49221 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM4P49221 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM4P49221 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM4P49221 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM4P49221 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM4P49221 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM4P49221 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM4P49221 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM4P49221 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM4P49221 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM4P49221 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM4P49221 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM4P49221 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM4P49221 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM4P49221 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM4P49221 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM4P49221 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM4P49221 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM4P49221 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM4P49221 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM4P49221 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM4P49221 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM4P49221 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM4P49221 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM4P49221 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGM4P49221 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGM4P49221 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGM4P49221 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGM4P49221 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM4P49221 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM4P49221 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM4P49221 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM4P49221 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM4P49221 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM4P49221 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM4P49221 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM4P49221 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM4P49221 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM4P49221 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM4P49221 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM4P49221 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM4P49221 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGM4P49221 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGM4P49221 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM4P49221 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM4P49221 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM4P49221 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM4P49221 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM4P49221 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM4P49221 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM4P49221 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM4P49221 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM4P49221 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM4P49221 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM4P49221 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM4P49221 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM4P49221 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM4P49221 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM4P49221 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM4P49221 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM4P49221 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM4P49221 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM4P49221 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM4P49221 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM4P49221 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM4P49221 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM4P49221 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM4P49221 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM4P49221 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM4P49221 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM4P49221 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM4P49221 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM4P49221 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGM4P49221 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGM4P49221 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGM4P49221 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms