Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NESP48681 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
NESP48681 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
NESP48681 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
NESP48681 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
NESP48681 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
NESP48681 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC45.76■■■■■ 4.92
NESP48681 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
NESP48681 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
NESP48681 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
NESP48681 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
NESP48681 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
NESP48681 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
NESP48681 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
NESP48681 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
NESP48681 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
NESP48681 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC45.68■■■■■ 4.9
NESP48681 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
NESP48681 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
NESP48681 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.66■■■■■ 4.9
NESP48681 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NESP48681 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
NESP48681 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
NESP48681 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NESP48681 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC45.63■■■■■ 4.9
NESP48681 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
NESP48681 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NESP48681 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
NESP48681 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
NESP48681 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
NESP48681 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
NESP48681 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
NESP48681 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
NESP48681 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
NESP48681 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
NESP48681 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
NESP48681 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
NESP48681 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
NESP48681 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
NESP48681 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
NESP48681 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
NESP48681 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
NESP48681 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NESP48681 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NESP48681 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NESP48681 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
NESP48681 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
NESP48681 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
NESP48681 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
NESP48681 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
NESP48681 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
NESP48681 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
NESP48681 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
NESP48681 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
NESP48681 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NESP48681 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.88
NESP48681 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.88
NESP48681 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
NESP48681 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NESP48681 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC45.5■■■■■ 4.87
NESP48681 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NESP48681 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
NESP48681 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NESP48681 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
NESP48681 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
NESP48681 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
NESP48681 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC45.45■■■■■ 4.87
NESP48681 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
NESP48681 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
NESP48681 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
NESP48681 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
NESP48681 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
NESP48681 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
NESP48681 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
NESP48681 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
NESP48681 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
NESP48681 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
NESP48681 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
NESP48681 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NESP48681 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NESP48681 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NESP48681 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
NESP48681 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
NESP48681 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
NESP48681 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
NESP48681 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
NESP48681 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
NESP48681 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
NESP48681 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
NESP48681 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
NESP48681 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NESP48681 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NESP48681 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
NESP48681 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
NESP48681 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
NESP48681 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.84
NESP48681 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
NESP48681 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
NESP48681 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
NESP48681 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms