Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARCN1P48444 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ARCN1P48444 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARCN1P48444 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARCN1P48444 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCN1P48444 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARCN1P48444 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms