Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A8P48029 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A8P48029 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A8P48029 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms