Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN1BP46527 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN1BP46527 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms