Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
RANGAP1P46060 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
RANGAP1P46060 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
RANGAP1P46060 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RANGAP1P46060 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
RANGAP1P46060 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RANGAP1P46060 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms