Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SSR1P43307 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSR1P43307 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSR1P43307 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSR1P43307 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSR1P43307 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSR1P43307 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSR1P43307 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSR1P43307 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSR1P43307 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSR1P43307 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSR1P43307 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SSR1P43307 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSR1P43307 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SSR1P43307 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSR1P43307 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SSR1P43307 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSR1P43307 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSR1P43307 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSR1P43307 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSR1P43307 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSR1P43307 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSR1P43307 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSR1P43307 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSR1P43307 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSR1P43307 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSR1P43307 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSR1P43307 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSR1P43307 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSR1P43307 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSR1P43307 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSR1P43307 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSR1P43307 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SSR1P43307 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSR1P43307 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSR1P43307 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SSR1P43307 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSR1P43307 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSR1P43307 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSR1P43307 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSR1P43307 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSR1P43307 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSR1P43307 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSR1P43307 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SSR1P43307 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSR1P43307 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSR1P43307 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSR1P43307 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSR1P43307 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSR1P43307 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSR1P43307 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSR1P43307 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSR1P43307 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSR1P43307 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSR1P43307 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSR1P43307 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSR1P43307 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSR1P43307 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SSR1P43307 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSR1P43307 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSR1P43307 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSR1P43307 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSR1P43307 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSR1P43307 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSR1P43307 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSR1P43307 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSR1P43307 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSR1P43307 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSR1P43307 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSR1P43307 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SSR1P43307 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSR1P43307 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSR1P43307 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSR1P43307 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSR1P43307 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSR1P43307 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSR1P43307 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSR1P43307 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSR1P43307 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSR1P43307 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SSR1P43307 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSR1P43307 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SSR1P43307 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSR1P43307 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSR1P43307 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSR1P43307 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSR1P43307 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSR1P43307 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSR1P43307 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSR1P43307 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSR1P43307 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSR1P43307 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSR1P43307 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSR1P43307 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSR1P43307 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSR1P43307 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SSR1P43307 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSR1P43307 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSR1P43307 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSR1P43307 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms