Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A3P38919 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A3P38919 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A3P38919 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A3P38919 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A3P38919 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A3P38919 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4A3P38919 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4A3P38919 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4A3P38919 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4A3P38919 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EIF4A3P38919 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4A3P38919 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4A3P38919 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4A3P38919 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4A3P38919 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
EIF4A3P38919 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4A3P38919 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EIF4A3P38919 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4A3P38919 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4A3P38919 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4A3P38919 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4A3P38919 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
EIF4A3P38919 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4A3P38919 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4A3P38919 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4A3P38919 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms