Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPAP38571 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPAP38571 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPAP38571 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPAP38571 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPAP38571 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPAP38571 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPAP38571 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPAP38571 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPAP38571 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPAP38571 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPAP38571 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPAP38571 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPAP38571 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPAP38571 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPAP38571 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPAP38571 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPAP38571 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPAP38571 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPAP38571 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIPAP38571 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIPAP38571 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIPAP38571 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIPAP38571 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIPAP38571 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIPAP38571 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIPAP38571 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIPAP38571 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIPAP38571 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIPAP38571 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIPAP38571 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIPAP38571 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPAP38571 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPAP38571 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPAP38571 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPAP38571 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPAP38571 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPAP38571 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPAP38571 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPAP38571 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIPAP38571 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIPAP38571 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPAP38571 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPAP38571 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPAP38571 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPAP38571 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPAP38571 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPAP38571 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIPAP38571 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIPAP38571 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIPAP38571 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIPAP38571 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIPAP38571 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPAP38571 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPAP38571 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPAP38571 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPAP38571 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPAP38571 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPAP38571 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIPAP38571 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIPAP38571 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIPAP38571 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIPAP38571 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPAP38571 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPAP38571 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPAP38571 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPAP38571 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPAP38571 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPAP38571 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPAP38571 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPAP38571 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPAP38571 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPAP38571 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPAP38571 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPAP38571 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPAP38571 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPAP38571 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPAP38571 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPAP38571 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPAP38571 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPAP38571 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPAP38571 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPAP38571 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPAP38571 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPAP38571 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPAP38571 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIPAP38571 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIPAP38571 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIPAP38571 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIPAP38571 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIPAP38571 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1532.3 ms