Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA1P35221 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA1P35221 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CTNNA1P35221 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA1P35221 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms