Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA4P35212 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA4P35212 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
GJA4P35212 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJA4P35212 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA4P35212 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA4P35212 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA4P35212 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA4P35212 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA4P35212 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA4P35212 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA4P35212 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA4P35212 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA4P35212 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA4P35212 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA4P35212 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA4P35212 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA4P35212 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA4P35212 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA4P35212 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA4P35212 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA4P35212 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA4P35212 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA4P35212 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA4P35212 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA4P35212 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA4P35212 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA4P35212 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA4P35212 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA4P35212 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA4P35212 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA4P35212 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA4P35212 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA4P35212 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA4P35212 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA4P35212 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA4P35212 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA4P35212 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA4P35212 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA4P35212 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA4P35212 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA4P35212 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA4P35212 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA4P35212 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA4P35212 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA4P35212 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA4P35212 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA4P35212 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA4P35212 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA4P35212 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA4P35212 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA4P35212 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA4P35212 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA4P35212 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA4P35212 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA4P35212 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA4P35212 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA4P35212 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA4P35212 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA4P35212 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA4P35212 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA4P35212 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA4P35212 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA4P35212 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA4P35212 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA4P35212 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA4P35212 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA4P35212 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA4P35212 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA4P35212 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA4P35212 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA4P35212 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA4P35212 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA4P35212 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJA4P35212 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJA4P35212 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA4P35212 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA4P35212 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA4P35212 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA4P35212 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA4P35212 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA4P35212 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA4P35212 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA4P35212 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA4P35212 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA4P35212 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA4P35212 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA4P35212 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA4P35212 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA4P35212 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA4P35212 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms