Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD11P31277 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD11P31277 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD11P31277 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD11P31277 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms