Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRABP2P29373 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRABP2P29373 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRABP2P29373 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms