Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2E2P29084 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E2P29084 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E2P29084 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E2P29084 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms