Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GTF2E1P29083 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF2E1P29083 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GTF2E1P29083 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
GTF2E1P29083 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF2E1P29083 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms