Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF8P28908 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFRSF8P28908 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF8P28908 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF8P28908 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF8P28908 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms