Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGFR4P22455 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGFR4P22455 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGFR4P22455 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGFR4P22455 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms