Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NF1P21359 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NF1P21359 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NF1P21359 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NF1P21359 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NF1P21359 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NF1P21359 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NF1P21359 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NF1P21359 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NF1P21359 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF1P21359 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NF1P21359 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF1P21359 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NF1P21359 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NF1P21359 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NF1P21359 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NF1P21359 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NF1P21359 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NF1P21359 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NF1P21359 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NF1P21359 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NF1P21359 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NF1P21359 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NF1P21359 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NF1P21359 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NF1P21359 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NF1P21359 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NF1P21359 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NF1P21359 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NF1P21359 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NF1P21359 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NF1P21359 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NF1P21359 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NF1P21359 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NF1P21359 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NF1P21359 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NF1P21359 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NF1P21359 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NF1P21359 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NF1P21359 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NF1P21359 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NF1P21359 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NF1P21359 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NF1P21359 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NF1P21359 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NF1P21359 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NF1P21359 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NF1P21359 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NF1P21359 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NF1P21359 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NF1P21359 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NF1P21359 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NF1P21359 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NF1P21359 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NF1P21359 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NF1P21359 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NF1P21359 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NF1P21359 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NF1P21359 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NF1P21359 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NF1P21359 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NF1P21359 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NF1P21359 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NF1P21359 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NF1P21359 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NF1P21359 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NF1P21359 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NF1P21359 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NF1P21359 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NF1P21359 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NF1P21359 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NF1P21359 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NF1P21359 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NF1P21359 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NF1P21359 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NF1P21359 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NF1P21359 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NF1P21359 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NF1P21359 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NF1P21359 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NF1P21359 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NF1P21359 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NF1P21359 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NF1P21359 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NF1P21359 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NF1P21359 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NF1P21359 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NF1P21359 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NF1P21359 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NF1P21359 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NF1P21359 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NF1P21359 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.9 ms