Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3AP20336 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3AP20336 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3AP20336 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms